Per fare in modo che il CD resista agli agenti esterni (polvere, manipolazione, graffi, acqua, ecc.), viene stesa sulla superficie del disco uno strato protettivo (trasparente). In particolare, i CD-R sono dotati di un doppio strato protettivo, per aumentarne la resistenza e la durata nel tempo. Gli strati protettivi vengono fissati sulla superficie del disco attraverso una lampada a luce ultravioletta ad alta temperatura, per garantirne la perfetta aderenza sulla superficie del CD.